С проведением же русским правительством железной дороги в Маньчжурию с 1900 г. миссия стала расширять своё просветительское влияние. В 1903 г. в Харбине была построена Благовещенская церковь, которая 10 февраля 1918 г. сгорела дотла, лишь чудесно сохранилась икона Благовещения Пресвятой Богородицы. Сгоревший храм был восстановлен и в 1919 г. был освящен ныне почившим митрополитом Иннокентием. В 1920 г. заведующим благовещенским подворьем Пекинской Духовной Миссии был назначен епископ, затем архиепископ забайкальский, ныне харбинский и маньчжурский Мелетий.
29 августа 1929 г. совет кружка ревнителей церковного благолепия при этой церкви получает благословение к сооружению нового каменного храма.
7 июля 1930 г. план нового храма был утверждён Харбинской городской управой, 14 сентября того же года состоялось торжество закладки в присутствии многочисленных жителей Харбина. Чин основания храма совершил архиепископ Мелетий в сослужении миссийского и городского духовенства.
Проект храма, составленный инж. Б.М. Тустановским, производит прекрасное впечатление. Храм будет иметь придел во имя Преподобного Сергия Радонежского Чудотворца.
Тяжёлое материальное положение русской иммиграции в Харбине и мировая депрессия будет, конечно, неблагоприятно отзываться на деле постройки храма, но Строительный комитет, сознавая святость дела, уповает на милость Божию, покров Пресвятой Богородицы и молитвенное предстательство великого начальника земли Русской Преподобного Сергия и верит, что хотя и через продолжительное время величественный храм украсит скромную обитель Пекинской Миссии.
Пожертвования и денежные суммы на постройку храма принимаются в Благовещенском подворье Пекинской Духовной Миссии по Полицейской улице архиепископом Мелетием и казначеем строительного комитета игуменом Иосифом.